摘要： 通过对不同性别东乡绿壳蛋鸡的全基因组甲基化的差异分析，检测差异甲基化区域（DMR），分析KEGG通路，为东乡绿壳蛋鸡表观遗传学研究提供参考。试验选取6只120日龄的东乡绿壳蛋鸡，分为公鸡组（LE_COCK）和母鸡组（LE_HEN），每组3只鸡，采集血液提取DNA进行全基因组亚硫酸氢盐测序（WGBS）分析。结果表明：东乡绿壳蛋鸡全基因组上的mC率母鸡和公鸡分别为2.27%和2.03%，母鸡比公鸡高0.24个百分点（P ＞ 0.05）|CG岛是发生甲基化的主要序列类型，母鸡比公鸡高4.33个百分点（P ＞ 0.05）|CHG和CHH甲基化类型低于0.11%|CHG甲基化位点的第2位偏向于A|CHH甲基化位点的第2位偏向于A，第3位偏向于T|在CG类型序列中，内含子和3’UTR区域的甲基化水平均高于15%|5’UTR和外显子区域甲基化水平不足10%|16，25号常染色体和一条性染色体甲基化水平较高。东乡绿壳蛋母鸡甲基化水平更高的DMR相关基因在黏附斑，ECM受体互作通路，肌动蛋白细胞骨架的调控，MAPK信号通路等信号通路富集。东乡绿壳蛋公鸡甲基化水平更高的DMR相关基因主要在类固醇生物合成，Notch信号通路，泛素介导的蛋白降解等信号通路富集。研究表明不同性别东乡绿壳蛋鸡具有不同的DMR甲基化特征，母鸡骨骼肌生长发育通路DMR相关基因甲基化水平高于公鸡，而卵泡形成和雌激素相关通路的DMR相关基因甲基化水平低于公鸡。
[关键词] 东乡绿壳蛋鸡|血液|WGBS技术|DNA甲基化

关键词: 东乡绿壳蛋鸡, 血液, WGBS技术, DNA甲基化

中图分类号: 

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• S813.1