基于分离培养和高通量测序分析一种自然发酵饲料的微生物组成

doi:10.15906/j.cnki.cn11-2975/s.2022100030-03

中国饲料 ›› 2023, Vol. 1 ›› Issue (17): 7-14.DOI: 10.15906/j.cnki.cn11-2975/s.2022100030-03

基于分离培养和高通量测序分析一种自然发酵饲料的微生物组成

梁国健1，洪居恳1，丁茂昌2，薛明1，陈伟哲1，梁华芳1，温崇庆1 *
（1.广东海洋大学水产学院，广东湛江 524088|2.海南海昌对虾繁育有限公司，海南文昌 571300）

出版日期:2023-09-05 发布日期:2023-09-22
基金资助:
国家重点研发计划“蓝色粮仓”科技创新重点专项（2020YFD0900205）|廉江市养殖集团有限公司委托项目（009）
作者简介：梁国健，男，硕士研究生，从事水产微生物研究，
*通讯作者：温崇庆，男，博士，教授，从事海洋和水产微生物研究，

Online:2023-09-05 Published:2023-09-22

摘要/Abstract

摘要： 为揭示一种对虾养殖用自然发酵饲料的微生物组成，通过MRS、营养肉汤（NB）、豆芽汁（BSJ）平板分别计数其微生物含量，并对分离代表菌株16S rRNA或5.8S-ITS基因进行测序分析和鉴定；分别利用高通量测序16S rDNA V4区和ITS2区研究发酵饲料细菌和真菌菌群的多样性。分离培养结果表明：MRS、NB和BSJ平板对发酵饲料乳酸菌、细菌和酵母菌的计数结果分别为4.80×107、5.00×106、3.95×106cfu/g；从分离代表菌中鉴定出3种芽孢杆菌，4种分别属于慢生乳杆菌属、宿主关联乳杆菌属、干酪乳酪杆菌属和黏液乳杆菌属的乳酸菌，以及1种酵母菌库德毕赤酵母。高通量测序分析表明：乳杆菌科在发酵饲料细菌群落中占绝对优势，并包含20个分类操作单元（OTU）和9个属，其中乳杆菌属和黏液乳杆菌属相对丰度分别为66.95%和3.36%；假单胞菌科、依格纳季氏菌科和微杆菌科分别为第2、第3和第4优势科，其下的假单胞菌属、食肉蝇单胞菌属、假棍状杆菌属相对丰度分别为11.81%、10.16和3.58%；真菌群落中毕赤酵母科占绝对优势，其次为丝孢酵母科，两者分别完全由毕赤酵母属和丝孢酵母属构...更多
关键词：发酵饲料|分离培养|高通量测序|乳酸菌|酵母菌|芽孢杆菌|

关键词: 发酵饲料, 分离培养, 高通量测序, 乳酸菌, 酵母菌, 芽孢杆菌,

中图分类号:

S816.2

梁国健, 洪居恳, 丁茂昌, 薛明, 陈伟哲, 梁华芳, 温崇庆. 基于分离培养和高通量测序分析一种自然发酵饲料的微生物组成[J]. 中国饲料, 2023, 1(17): 7-14.

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